劇情簡介:
以635米的高度為傲、可以俯瞰東京街景的鈴木塔
(註:以現實中634米的東京晴空塔為原型)竣工。前往參加其開幕儀式的柯南等人,從眺望臺上享受著絕美的景色。就在此時,一發子彈擊碎了窗戶玻璃,打穿了一個男人的胸膛。案件發生於一瞬之間,完全搞不清到底發生了什麼,小蘭與少年偵探團都陷入了恐慌。
柯南立刻利用追蹤眼鏡的望遠鏡功能,沿著彈道發現了一個黑色的身影。“從那麼遠的距離進行狙擊,怎麼可能?!”柯南馬上與女高中生偵探世良真純乘坐摩托車追趕逃走的狙擊手,意想不到的是狙擊手居然連警察的巡邏車都打算一起炸掉,整個追蹤過程都被其玩弄於股掌之中。結果,這場激烈的追蹤將FBI也卷入其中,犯人以及狙擊事件的謎團都消失在了大海裏。
於是柯南和世良協力,而警察和FBI合作調查此案,終於查出了美國海軍特種部隊“海豹突擊隊(Navy Seals)”的存在。其實這起狙擊事件不過是接下來將發生的大混亂的第一步!與此同時,住在工藤新一家的神秘研究生沖矢昴也不動聲色地秘密行動起來……